分析微阵列（芯片）也称为捕获阵列。在这种技术中，在支撑表面上排列着一个抗体、适配体或新配体库。这些被用作捕捉分子，因为每一个都与特定的蛋白质结合。当捕获分子是抗体时，它通常被称为抗体(微)阵列。分析蛋白微阵列代表性的模型是抗体阵列。该阵列采用复杂的蛋白质溶液，如细胞裂解液。利用各种检测系统分析产生的结合反应，可以提供样品中特定蛋白质的表达水平信息，以及结合亲和性和特异性信息。这种微阵列在比较不同溶液中的蛋白表达时特别有用。例如，细胞对某一特定因子的反应可以通过比较特定物质处理的细胞的裂解物或在某些条件下与控制细胞的裂解物一起生长来确定。另一种应用是对病变组织的鉴定和分析。
从技术上讲，蛋白质组学研究中常用的有两种抗体阵列。其中一种是基于ELISA双抗体夹心法，另一种是基于分析标签的ELISA直接法抗体阵列。
ELISA 双抗体夹心法抗体阵列：
酶联免疫吸附实验 (ELISA) 是一种利用抗体和颜色变化或荧光信号强度来鉴别物质的实验。在固体支架上(通常是 NC 膜或玻片)固定有未知数量抗原的样本，通过另一种特定于同一抗原的抗体进行捕获。将抗原固定后，加入检测抗体，形成与抗原结合的复合物。检测抗体可以与一种酶共价连接，也可以通过与酶或荧光素结合的次级抗体来检测。在每一步之间，通常用温和的洗涤剂溶液清洗，去除任何非特异性结合的蛋白质或抗体。在终的洗涤步骤之后，通过添加酶底物或激光扫描仪激发的激光扫描来产生一个可见的信号来表明样品中抗原的数量。
直接抗原标记型抗体阵列：
另一种抗体阵列应用的模型是"分析标记"格式。在这种形式下，通过直接蛋白标记检测抗体捕获后的蛋白质。在直接标记法中，复杂混合物中所有蛋白质的共价标记提供了一种检测抗体微阵列孵育后的结合蛋白的方法。如果蛋白质被标记为标签，如生物素，信号从结合蛋白可以被放大。通过一个简单的抗原标记过程，样品蛋白直接与生物素结合，消除了第二种抗体的需要来发展阵列信号。在这种格式中，非预期的抗体交互是不可能的，从而消除了数组面板大小的限制。
两种抗体阵列对比：
SBI 抗体或蛋白质玻璃芯片"LucidArray?"是化学发光膜阵列后的进化阵列平台。LucidArray? 使用 SCHOTT NEXTERION? 载玻片的平台。这些玻片是由高质量的硼硅酸盐玻璃制成，具有超平面和低固有荧光，具有一个均匀的层，提供高共价耦合效率和非常低的背景。与基于NC膜的微阵列相比，基于载玻片的微阵列容易处理，且使用更低的样本量(只要10μl /数组)。玻片也利用荧光信号读出，允许比化学发光更广泛的动态检测范围。
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